Koeficient inbreedingu (COI): co znamená a jak ho číst

COI je číslo, které chovatelé řeší u každého plánovaného spojení. Vysvětlíme, co přesně vyjadřuje, jak se počítá a proč stejné spojení může vyjít jednou 3 % a jindy 9 %.

Aktualizováno:

Ve zkratce

  • COI (koeficient inbreedingu) je pravděpodobnost, že potomek zdědí po obou rodičích stejnou kopii genu od jejich společného předka.
  • Počítá se z rodokmenů obou rodičů Wrightovou metodou. Čím hlubší a úplnější rodokmen, tím přesnější a obvykle vyšší výsledek.
  • Orientačně: rodič × potomek nebo úplní sourozenci 25 %, polosourozenci nebo děd × vnučka 12,5 %, bratranec × sestřenice 6,25 %.
  • Univerzálně bezpečná hranice neexistuje. Hodnoty porovnávejte vždy při stejném počtu generací a řiďte se pravidly svého klubu.

Co COI vyjadřuje

Zvíře má od většiny genů dvě kopie – jednu po otci a jednu po matce. Když mají otec a matka společného předka, může potomek zdědit obě kopie právě od něj. Takové kopie se označují jako identické původem. COI udává pravděpodobnost, že se to stane na libovolném místě genomu.

COI 0 % znamená, že v počítané hloubce rodokmenu nemají rodiče žádného společného předka. COI je vlastnost potomka: popisuje příbuznost jeho rodičů, ne rodiče samotné. Proto se dá spočítat i pro spojení, které teprve plánujete.

Proč na COI záleží

S rostoucí příbuzností rodičů roste pravděpodobnost, že se u potomků projeví recesivní dědičné vady, které jsou u rodičů skryté. Dlouhodobě vysoká příbuzenská plemenitba se v populaci spojuje také s poklesem plodnosti, velikosti vrhů a vitality – takzvanou inbrední depresí.

COI je jeden z nástrojů odpovědného plánování, ne jediný. Vedle něj rozhodují zdravotní a genetické testy obou rodičů, exteriér a povaha.

Jak se COI počítá

Nejpoužívanější je Wrightova metoda. Pro každého společného předka se najdou všechny cesty, které vedou od otce přes tohoto předka k matce. Každá cesta přispěje hodnotou (1/2)ⁿ, kde n je počet zvířat na cestě včetně otce, matky a společného předka. Pokud je inbrední i sám společný předek, jeho příspěvek se zvýší o jeho vlastní COI. Příspěvky všech cest se sečtou.

Orientační hodnoty pro běžná spojení

SpojeníCOI potomka
Rodič × potomek25 %
Úplní sourozenci25 %
Polosourozenci12,5 %
Děd nebo babička × vnuk nebo vnučka12,5 %
Strýc nebo teta × synovec nebo neteř12,5 %
Bratranec × sestřenice6,25 %
Polostrýc × poloneteř6,25 %
Platí za předpokladu, že ostatní předci nejsou příbuzní.

V reálných rodokmenech se často sčítá víc společných předků najednou, takže výsledek vychází vyšší než v tabulce.

Proč výsledek závisí na počtu generací

Každá další generace může odhalit společné předky, kteří v kratším rodokmenu nejsou vidět. COI ze 4 generací proto téměř vždy vychází nižší než COI z 10 generací pro totéž spojení. Číslo bez uvedené hloubky neříká mnoho: 5 % ze tří generací a 5 % z dvanácti generací znamená úplně jinou míru příbuznosti.

Jaká hodnota COI je v pořádku?

Univerzální hranice neexistuje. Záleží na plemeni – u plemen s malou genovou základnou bývá COI vysoký i u spojení, která v posledních generacích příbuzná nejsou –, na počtu generací a na pravidlech chovatelského klubu. Praktický postup:

  • Zjistěte, jaké limity nebo doporučení má váš klub a plemenný poradce.
  • Porovnávejte plánované spojení s běžnými hodnotami v plemeni při stejné hloubce rodokmenu.
  • Pokud máte na výběr ze srovnatelných partnerů, dejte přednost spojení s nižším COI.
  • Nespoléhejte jen na COI – zohledněte zdravotní a genetické testy obou rodičů.

Jak COI spočítat v Breediu

V modulu Genetika vyberete otce a matku – i pro plánované spojení ještě před krytím – a zvolíte počet generací. Breedio spočítá COI Wrightovou metodou z rodokmenů obou rodičů. Předky porovnává podle registračních čísel a jmen, takže stejné zvíře pozná i v rodokmenech zapsaných různě.

Přesnost závisí na úplnosti rodokmenů. Chybějící předky doplníte ručně, importem z fotky průkazu původu nebo z odkazu PawPeds či BreedArchive.

Zdroje

  • Wright, S. (1922): Coefficients of inbreeding and relationship. The American Naturalist 56, 330–338.

Související